Thomas e i suoi compagni dovranno affrontare un’altra grande sfida: trovare nuovi indizi sulla misteriosa e potente organizzazione WCKD. Il loro viaggio li porterà in una landa desolata, la Zona Bruciata, piena di ostacoli e insidie. Con l'aiuto della resistenza, si troveranno ad affrontare la potentissima WCKD e sveleranno gli sconvolgenti piani che aveva in serbo per loro.