Ang THE GENIUS KID: X-CLASS ay binubuo ng limang estudyante na nagmula sa mayayamang angkan sa buong asya. May isang organisasyong binuo ng kanilang mga magulang noong panahon pa ng mga ito. Tinatawag itong X organization, kung saan sila ang tumutulong sa gobyerno na na mapaayos ang pamamalakad sa Pilipinas. Ang limang batang iyon ay ipinasok ng kanilang mga magulang sa akademyang pagmamay-ari ng ama sa isa sa mga estudyante ng X ACADEMY.
Sa X Academy pinapaaral ang mga batang henyo sa kahit na anong larangan. Pakikipaglaban, patalinuhan, pakikipag bakbakan at iba pa. Ipapasailalim muna sa isang assessment test ang mga MAG aaral sa X Academy ago nila simulan ang kanilang klase sa unang araw ng pasukan. Ngunit syempre, hindi iyong assessment test na iniisip ng karamihan ang mangyayari. Isang madugong paglalaban ng mga hunters ng akademya at mga mag-aaral. Kung sino man ang unang makakapasok sa administration's building kung saan secured, ay syang mananalo at magiging bahagi ng makabagong henerasyon ng X Class.
Hindi inaasahan ng limang bata na magkikita-kita sila sa loob niyon. Walang galos, walang pawis at walang pagod silang nakapasok sa administration's building. Magmula sa araw na 'yon. Naitalagang sila na ang susunod na X Class at susuong aga sila sa isang misyon na naghihintay sa kanilang pagdating.